人人都想成為五大主力，人人也都想成為五大主力之首的新一軍。但編制就這麼多，五個軍滿員全編不過11萬人，而太平軍現有陸師37個鎮，去除水份也有近三十萬人，這意味著能夠入編五大主力的部隊不僅要是能打的精銳，更得是嫡系。
葛義過江後，拍著胸脯對周士相說，這五大主力的新一軍不從他江北軍中編組，那就是看不起他葛老六。
蔣和也從安慶屁顛屁顛的乘船趕到鎮江，聽說葛老六要搶新一軍，二話不說就和他爭了起來，天王老子勸也沒用。
鐵毅也從駐地常州趕了過來，如此一來，老四鎮的四大鎮將除了現在貴州主持西南軍政的邵九公，三大巨頭都已到齊。
在鎮江的還有剛剛在松江平亂的蘇納和王輔臣等將領，他們無一不是可以獨當一面的大將，除了資歷不如老四鎮的四大“巨頭”，戰功方面並不差他們多少，甚至還有過之。
一直以來，對軍政大事不感興趣，並且以呆在周士相身邊當侍衛統領為榮的瞎子李不知道腦子怎的發起熱來，也加入到了這五大主力的爭搶之中。他和同樣有心在五大主力分一杯羹的王輔臣結成了盟友，一塊對抗老資歷的葛老六和蔣禿子。
周士相懶得聽這幫大將們在那訴忠心，倒苦功，這幾天他讓徐應元替他擋客，不管是誰一律不見，只在軍部那裡和郭雄等人商議五大主力的編組及餘下各鎮的改編。
最終，五大主力組成鎮正式確定，並且又將現有37個鎮區分為甲級鎮、乙級鎮、丙級鎮。
甲級鎮為一線野戰軍，乙級鎮為二線支援軍，丙級鎮為地方軍。
甲級鎮下設三旅加鎮直屬炮兵、工兵、輜重部隊；乙級鎮同樣下轄三旅，但沒有炮兵和工兵，只有輜重部隊；丙級鎮下設兩旅，無炮兵、工兵，亦無輜重部隊。除此之外，甲級鎮中必須有兩到三個戰鬥英雄部隊（團以下），並保留成軍之初授予的軍旗。乙丙二鎮則無此要求。
初定全軍甲級鎮8個，乙級鎮14個，丙級鎮15個。為了區分，甲級鎮為“整”字頭，乙級鎮為“新”字頭，丙級鎮為“暫”字頭。如整一鎮、新三鎮、暫五鎮等。
8個甲級鎮中，有3個是純火器鎮，其中一個更是全鎮裝備了軍械局剛剛才能大規模生產的燧發槍。其餘五個，都是冷熱兵器混合編成，乙丙鎮則多半都是冷兵器為主。
新一軍由原王輔臣的騎兵第一鎮和現隸屬江北軍的齊豪第一鎮組成，番號改為整編第一鎮、新編第一鎮。軍部駐地暫為江蘇淮安，軍長由王輔臣出任，總鎮由齊豪出任。
新二軍由原蘇納第六鎮和邵成國的騎兵第二鎮組成，番號為整二鎮、整三鎮。軍部駐地暫為揚州，軍長由蘇納出任，總鎮由邵成國出任。
新三軍由李匡明的第五鎮和江北軍朱慶來的新二鎮組成，番號為整四鎮、新二鎮。軍部駐地暫為蘇州，軍長由李匡明出任，總鎮為朱慶來。
新四軍由原安徽巡撫蔣和的第三鎮和尚可遠的新三鎮組成，番號為整五鎮、新三鎮。軍部駐地安慶，軍長由軍部官郭雄出任，總鎮為尚可遠。
新五軍由原西南野戰軍王有喜的第四鎮和盧光祖的遠征軍第二鎮組成，番號為整六鎮、整七鎮。軍部駐地貴陽，軍長王有喜，總鎮盧光祖。
五大主力中，除新二軍、新五軍都是由兩個甲級鎮組成外，其餘三個軍都是一個甲級鎮、一個乙級鎮組成。
總共八個甲級鎮，五大主力就佔了七個，餘下一個則是由李瞎子統領的周士相直屬衛隊和於世忠之子於佑明的火器旅改編而成，番號為整八鎮。對這個結果，李瞎子還算滿意，雖說沒能當上一軍之長，但也混了個甲級鎮將，且還是大帥身邊的近衛鎮，算起來不比一軍之長差。
原胡啟立的第七鎮、韓朝宗的第十七鎮、王興的第十鎮、甘輝的第十六鎮、耿仲德的第十四鎮、郭登第的第九鎮、蔣和在安徽新編的兩鎮（鎮將為張勇和李本深）、浙江以清軍降兵為主改編的兩鎮（鎮江為裘德、鄂多）、廣東宋襄公的兩鎮（鎮江為原南陽總兵張超、原花縣千戶黃四成）都被定為乙級鎮。餘下各鎮則一律定為丙級鎮。
各部番號正式確定後，將從現在的駐地調防，軍部初步估算，全部調防完畢最少需要半年時間，因此當前主要是五大主力的整編和調防。
軍隊調防不是接到命令就啟程這麼簡單，還牽扯到家屬安置，營地交接、防區整頓等瑣事，並且需要調防的各鎮大多是步兵為主，受交通道路限制，難以短期集結完畢。就如現駐紮在金廈的胡啟立部要調防至安慶，上千里路程下來，光靠腳板底走，就夠胡部喝一壺的了。
五大主力整編方案出臺後，最高興的人無疑就是葛老六了，因為他江北軍的四個鎮有三個被定為甲級鎮，且新一軍和新二軍的駐地都在他江淮經略使的地盤，因此他得意洋洋，以為自己現在是兵強馬壯，可以一下指揮兩大主力。一眾老兄弟中，哪個也沒他這麼露臉。不想高興沒到兩天，軍部新的方案又出臺了，卻是取消了現有各軍團編制。
因為之前有過軍團一級的編制，現在新建軍一級編制，難免和軍團這一級職能重合，導致指揮系統混亂。所以周士相決定將現有各軍團編制一律裁撤，正式恢復大都督府這一洪武年間節制中外諸軍事的機構。
當日從廣州北伐時，周士相用的就是大都督的名義，只是卻沒有恢復大都督府，而是一直以齊王府和軍部來執行大都督府的功能。現在重新恢復大都督府，將齊王府和軍部的相關職司併入大都督府，也算是周士相對太平軍軍政體系的一次整合。
周士相本人出任大都督，下轄五軍都督，即中軍都督、前軍都督、後軍都督、左軍都督、右軍都督。