靈璧之戰的勝利為燕軍開啟了南下的大門，他們如猛虎下山，勢不可擋。五月初七，燕軍一路向東南方向直線前進，迅攻下了泗州。這座城市的陷落，為燕軍提供了一個重要的補給點和戰略支點。
稍作休整後，燕軍繼續揮師南下。五月十一日，他們向揚州方向挺進，一路勢如破竹。短短几天后，五月十七日，燕軍便抵達了天長（位於揚州西北5o公里）。天長的守軍雖然進行了頑強的抵抗，但在燕軍的強大攻勢下，最終敗下陣來。
揚州的監察御史王彬本有意組織抵抗，但不幸的是，他的屬下生了反叛。這些人在他沐浴時突然難，將他綁縛起來，使得揚州的防守力量大打折扣。五月十八日，面對燕軍的威逼和內部的混亂，揚州最終選擇了不戰而降。
揚州的陷落對南軍來說是一個巨大的打擊。這座重要的城市不僅是南方的政治、經濟中心之一，也是南軍的重要防線。揚州的失守使得南軍的防線出現了巨大的缺口，燕軍得以長驅直入，進一步深入南方腹地。
隨後，高郵也在燕軍的威逼下選擇了歸降。這一系列的勝利使得燕軍的聲勢達到了頂點，他們在南方的土地上如入無人之境，南軍的抵抗力量已經難以阻擋他們前進的步伐了。
濟南城中，徐輝祖、平安、盛庸、耿炳文等人在平行的歷史線上正在南方抵禦朱棣的進攻，此刻卻還是困守城中，濟南已經成為一個孤城。外無援兵。整個山東都投降了，包括曲阜孔家的後裔都投降了，他們都上表對朱棣表忠心！
盛庸說：“也不知道朱棣此刻到了哪裡了，朝廷的增援力量阻截成功沒有？”
徐輝祖長嘆說：“估計到長江了吧，阻截？呵呵，估計朝廷現在連自保都困難了！”
耿炳文大驚失色說：“那不是要渡過長江了？”
徐輝祖站起來望著天空說：“長江不是那麼好渡的。”他舉手抱拳向天致敬說：“太祖高皇帝留了一手，估計此刻應該揮作用了。”
平安恍然大悟，一下子站起說：“你說的是長江水師！”
燕軍先鋒兵臨長江北岸，屯兵浦子口，朱棣的部將柳升下令蒐集船隻渡江，一路朱棣的確打得太順利了！憑藉著犀利的武器和訓練有素的軍隊，將建文的軍隊打得節節敗退，兩次大戰役幾乎消滅了建文朝廷的有生力量。
鋪子口，柳升正在指揮軍隊上船，這些船都是附近蒐集來的，上船的是鳳陽帶出來的老部隊。是燕軍中最為精銳的，他們自告奮勇做先鋒。
柳升大聲鼓舞道：“當年燕王當百戶的時候，我們就是他的第一批兵，今天我們回來也要做過江的第一批兵，打進金陵去，推翻建文小兒，讓燕王做皇帝，只有燕王做了皇帝，天下百姓才有好日子過。大家說是不是？”
船上的軍官和士卒們大聲歡呼響應！
一個軍官說：“當年我們被衙役欺負，那個慫逼樣子真的沒有法看，是燕王來了。那時都不知道他是王爺。他夠狠，帶著我們收拾了幾次來收稅的衙役。又給我們修房子，又整肉吃。又分田，從那一刻我就決定一直跟著他走。”
這個時候遠處的江面上隱約出現了大船。柳升用望遠鏡一看，是南軍的水師，他明白自己輕敵了！他大聲下令：“快，朝回走，前面有南軍的戰船！”咱們打不了！
就在朱棣準備揮師渡江，一舉拿下南方的時候，南軍的水師突然出現了。他們駕駛著堅固的戰船，如同猛虎下山般衝向燕軍的船隻。船上的弓弩手和礌石射器齊齊射，密集的箭矢和巨大的石塊如同暴雨般傾瀉而下，將燕軍收集的船隻摧毀殆盡。
江面上瞬間燃起了熊熊大火，燕軍的船隻被擊中後紛紛起火燃燒，濃煙滾滾，火光沖天。許多燕軍士兵還未來得及反應，就被火海吞噬，出了悽慘的呼喊聲。江面上漂浮著大量的殘骸和屍體，戰況慘烈無比。
然而，燕軍並沒有坐以待斃。他們迅組織起岸邊的遠端炮火進行反擊，火炮轟鳴聲響徹雲霄，炮彈在江面上炸開，激起巨大的水柱。燕軍的炮火有效地阻止了南軍水師的進一步攻擊，否則他們很可能會對岸上的燕軍造成更大的麻煩。
儘管南軍水師在戰鬥中表現出色，取得了開戰以來的第一次勝利，但可惜的是，這並無法改變整個戰局。長江以北的地區已經被朱棣牢牢控制，南軍已經失去了戰略上的主動權。這場戰鬥雖然慘烈，但也只是整個戰爭中的一個小插曲而已。
朱棣在接到戰報後，並沒有如建文一樣脾氣，而是冷靜的傳達軍令：“向北平傳令，通知，駐守天津的水師南下，我要控制整個長江，看看誰更厲害”
戰報傳回金陵，建文勉強鬆了一口氣，暫時不用擔憂燕軍渡江了！
齊泰說：“皇上，這隻能緩一時，我覺得我們還是要做議和的準備！”
方孝孺又開口了“：皇上，千萬...”建文打斷了他：“方師傅，不要插話！”
另一個臥龍不在，已經被貶回家去了！
齊泰繼續說：“一方面我們派人前去和朱棣議和，拖延他進攻的時間，另一方面我們要繼續抽調水師駐守長江， 燕軍多數是北人，不習水戰，無法抗衡，一時之間肯定無法渡江，我們不能再進攻，要集中力量防守，號召天下勤王！”
建文點頭同意，就按你說的辦吧，這一次他已經聰明瞭，沒有再聽臥龍鳳雛的。
五月二十二日，朱允炆遣慶成郡主（朱元璋的侄女、朱棣的堂姐）與朱棣談判。慶城郡主對小的時候的朱棣很好，每次進宮都帶朱棣玩，也給他帶好吃的，這是促使朱棣開小吃店的靈感來源！朱棣對於她一直很尊重。所以對於堂姐的到來很是熱情！
到了大帳中，朱棣設宴款待，與徐輝祖第一次去北平一樣的菜，姐弟倆在桌上不談國事，只吃飯。
飯後，慶成郡主說“四弟，大家都是一家人，你和允文搞成這樣，於國於家都不是好事，能否罷兵議和？”
朱棣把茶水親自端給堂姐說：“那建文是什麼意思呢？”
慶成先說：“建文的意思是，你退兵回北平，之前的事情當沒有生，他不會追求，恢復你的王爵。”
朱棣聽後哈哈哈大笑起來！反問：“姐姐，你覺得可能嗎？意思是大家玩遊戲呢？如果是我失敗了，我讓朱允炆不要抓我，我繼續當我的燕王，不南下。不起兵，你覺得朱允炆會答應嗎？”