結束了海洋杯錦標賽，遊輪還在持續前進中，在途中幾人也是參觀了第二個島嶼，那就是扇貝貝島！
據說是由貝殼所堆積而成的島嶼，在這裡每年都會聚集著雙刃丸與水水獺的訓練家，並且舉行扇貝貝王爭奪戰！
現在小智的水水獺早就進化成了大劍鬼，自然是不可能參加這種比賽，於是眾人僅僅只是遊玩並旁觀了比賽就繼續踏上了旅程！
在這途中經過了一個迷霧海域，突然出現的巨大幻影引起了小智幾人的注意，經過調查，來到了馬赫拉本島附近的無人島上！
來到無人島上之後，突然又出現了一個巨大的食爐蟻，很快小智就看出就是索羅亞克或者是索羅亞釋放的幻象。
於是小智便讓索羅亞跟它比試了一番，它的本體也很好尋找，就在早已報廢的神奇寶貝中心！
剛到那裡的時候，索羅亞克還唱起了雙簧，一會兒喬伊小姐，一會兒差不多娃娃！
不過小智現索羅亞克正在利用樹果草藥製造成藥膏為森林中的神奇寶貝們治療，經過了解這才知道，原來之前的巨大幻影都是索羅亞克為了嚇跑來這裡的神奇寶貝獵人所幻化的。
這一切的一切都是為了島上的神奇寶貝們！而這隻索羅亞克曾經被這座島上的喬伊小姐救過，後來由於神奇寶貝中心的關閉，碰巧那個時候索羅亞開始進化，兩人最終沒有見到最後一面！
不過緣分就是那麼巧合，正好由於這裡違法營業神奇寶貝中心，神奇寶貝中心的調查員來到了這裡，而她就是曾經這裡的喬伊小姐！
她瞭解了事情的經過之後，也是感動不已！於是有著小智作為擔保人，她打算與索羅亞克一起重開這裡的神奇寶貝中心！
接下來小智一行人又到了姆託洛島，在那裡重逢了大木博士，而大木博士之所以來這裡是為了想寫一篇關於洛託姆改變形態的論文！
雖然小智的他已經觀察了好久，但是現在的洛託姆大多時間待在靈界，所以大木博士想要自己收服一隻洛託姆，而這座島嶼上正有著有關洛託姆的傳聞。
在小智幾人的幫助下，再加上火箭隊三人組的助攻，大木博士很是順利的收服了一隻調皮的洛託姆。
告別大木博士，幾人的航海之旅還在繼續，途中還遇到了被譽為傑克羅拉群島的海賊王，在小智的協調之下，這才現他們都是些被訓練家拋棄的神奇寶貝，所以才會流落在海上成為海賊王！
於是小智便將它們全都打包帶走，透子對於是成都御三家對藍鱷很感興趣，畢竟到現在為止她還沒有收服到水系神奇寶貝！
就這樣一場收服戰就此展開，雖然沒有懸念，但作為海賊王的領藍鱷還是有兩把刷子的，再加上這是在海上，交戰了許久，這才成功將它收服！
其中的鴨寶寶，小霞可是眼饞許久了，一直想要來合眾收服一隻，正好將這隻送給了她來培養。
而剩下的瑪力露麗、章魚桶小智自然也是看不上，就讓它們直接去了自己的島上，那裡的物資豐富，足夠它們生存了！
隨後又來到了遷徙島，在這裡進行遷徙的神奇寶貝們，休息時會短暫的駐足這座島嶼！
難得的遷徙美景，幾人自然不會就這麼錯過，正巧趕上了巴大蝴族群的遷徙。
於是小智向著眾人說起了他曾經遇到過的兩次巴大蝴遷徙，尤其是第二次不僅巴大蝴迴歸，更是鼓起勇氣向小遙小霞表白，那番浪漫的場景，讓幾人感動不已！
巴大蝴族群的遷徙很快就開始了，這番令人震撼的場景，不管見幾次也是讓人很是感動！
小智更是默默的牽上了芽衣與透子兩女的手，三人的關係也是正式確認。
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“小智，這座大島是傑克羅拉群島中面積最大、大自然景象也是最豐富的島嶼！有非常多野生神奇寶貝棲息在這裡呢！”
從遷徙島出，小智一行人登上了這座大島，天桐更是早已查閱好資料，向眾人介紹道。
“島嶼的另一頭也有港口，我們可以從那裡乘船繼續出！”天桐笑道。
出現在眾人眼前，是一片美麗的花叢，所有人都歡呼的在裡面遊玩了起來，艾莉絲的牙牙也是摘了兩朵鮮豔的紅花，歡呼的跑過來獻給她！
玩了一段時間，穿過這片茂密的草原之後，再翻越一座高山，出現在幾人眼前的卻是另一番場景！
河水乾涸，大地皸裂！
明明只是隔了一座山，兩邊簡直是天差地別，這裡寸草不生，顯然早已持續了很長一段時間的乾燥！
但是由於之前玩鬧耽誤了些許時間，現在太陽已經快要落山了，眾人也不得不在這乾旱的土地上暫時露營！
就在幾人準備晚餐的時候，芽衣突然指向在不遠處有著一圈尖銳石柱的地方，好奇的詢問道，“咦？小智哥，那是什麼呀？”
小智眼神一凝，他清楚的感覺到那邊的力量正在逐漸復甦，“是基拉祈？這裡竟然有基拉祈，而且我們正好趕上了它的復甦！”
對於基拉祈，小智還是很有好感的！要知道小智覺醒前世記憶以來遇到的第一隻神明，不僅讓當時小智的神奇寶貝實力大突破，而且讓皮卡丘與伊布蛻變成了搭檔神奇寶貝！
這也是伊布開掛的！
不過這隻明顯不是那一隻，不說其在豐緣的法恩斯沉睡，那隻基拉祈的千年沉睡才幾年，不可能這麼快復甦。
也就是說它應該是後輩，僅僅只是神獸層次而已！
“幻之神奇寶貝，基拉祈？”
眾人聞言也是大驚，吃過晚飯後，紛紛圍在了石柱周圍，準備見證基拉祈的復甦。
未完待續
突然現這群島之旅好沒有意思啊～能跳的都會跳過，在這裡主要是寫劇場版神的蓋諾賽克特與夢的覺醒，還有三色堇那段劇情，然後直接開卡洛斯！
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