黑暗中，體積小的戰艦使用精度不高的滑膛炮對轟，命中率自然低得可憐。但是明軍艦隊轟擊炮臺又不一樣了，固定的炮臺又不會跑動，體積又大，滑膛炮命中率再低，要擊中炮臺也不是一件困難的事情。
幾輪炮擊過後，清軍炮臺上反擊的火力越來越弱。
早有明軍小艇靠近岸邊，不計其數計程車卒跳下小船登上岸，從炮臺的背後起攻擊。
江面的激戰仍然在進行之中，王新宇一聲令下“放出火攻船！現在是漲潮，海水倒灌進入江中，水流對我們有利。”
一艘艘火攻船從明軍戰船隊之中駛出，順著水流向清軍戰船隊殺去。雖然江中有攔江索，江底還有水下暗樁，但火攻船吃水淺，而且是漲潮，水位還在上升，不管是攔江索還是水下暗樁都攔不住吃水不到一米的火攻船。
“明狗的火攻船來了！”藉助著月光的照明，清軍現了正在向自己靠近的火攻船。
“放箭！”一名清軍把總焦急的喊道。
清軍戰船上射出一排排火箭，大部分箭支落進江中，有少數火箭射中了正在靠近的明軍火攻船，點燃了船上堆積的柴禾，幾條中箭的火攻船頓時燃起大火。但火攻船本來就不怕火燒，起火之後，後面的明軍仍然划著船，向清軍戰船衝去。
“快開炮！不要讓明狗靠近！”清軍大船上的軍官喊道。
藉助著火光的照明，已經可以清晰看到海面上熊熊燃燒的火攻船。幾艘清軍最大的戰船噴出火光，炮彈掠過江面，砸向正衝近的火攻船。
江面上騰起一道道沖天水柱，有火攻船中了炮彈，船板橫飛，破碎的木板砸在划船的水兵身上，有人被彈片一樣木頭刺入身軀，有人被木板砸中頭部。受傷的明軍慘叫著倒下，但沒有傷亡的人繼續划著船向清軍衝去。
畢竟清軍戰船太小，射兩三斤重的實心炮彈想要擊沉火攻船也不是那麼容易的事情，中國式的船隻都有隔艙，除非被大的炮彈擊中才能一炮擊沉。小炮擊中，不過穿個洞，還不至於馬上沉沒。
火攻船繼續向清軍戰船靠近，後面的明軍大型戰船也不停開火。黑暗中閃爍著一道又一道火光，看起來就像黑夜裡的閃電一樣。
“轟”一艘火攻船撞上了一艘清軍的蒼山船，火攻船頭部的釘子扎入清軍船上，把兩艘船牢牢的釘在一起。熊熊燃燒的大火很快就蔓延清軍戰船上，只聽到大船上一片鬼哭狼嚎的哭喊聲，清兵紛紛跳進江中逃生。
不一會兒，又是一艘火攻船撞上了清軍一艘大船，把那艘大船點燃成火船。
“小船！小船攔住蠻子！”清軍軍官大喊。
清軍的小船衝了出來，向火攻船衝去，企圖攔住火攻船。與此同時，明軍的小船也從大船隊中衝出，向清軍小船殺了過來。
小船和小船之間的交手，仍然是傳統的接舷戰。雙方的小船相互對沖，在靠近之前，弓箭手射出一排亂箭。接近之後，雙方小船上的水手用長竹竿向對方小船一通亂刺，接著雙方小船上的刀斧手才跳過去，跳上對方的船砍殺。
畢竟明軍水師都是久經沙場的老兵一代代相傳下去，水戰靈魂的核心一脈相承，帶出來的新兵也都精通水上作戰。而清軍的水師多次全軍覆沒，又一次次重新組建，擅長水戰的老兵早就損失殆盡，新組建的水師素質可想而知了，更何況，清軍水師重點是放在泉州和漳州一帶，福州水師就是一群菜。
明軍水兵憑藉自己精湛的技術，或者是撞翻了清軍的小船，或者是跳上去把清軍小船上的清兵砍殺一空。
江面上殺聲震天，刀光閃爍，斧頭揮舞，清兵的人頭接連被砍落到水中。
還有一些水性特別好的明軍水手乾脆跳進水中，幾個人齊心協力從水下弄翻了清軍的小船，或者是把小船上的清兵拉下水去。在水中，清兵根本不是對手，落水的清兵被明軍摁在水裡活活淹死。
轉眼之間，清軍小船隊就被打得落花流水。
幾艘明軍的小船上前，熟悉水性的水手跳進水中，把水雷綁在攔江索上，點燃離開。
“轟”江面上騰起了沖天水柱，攔江索被炸斷。
負責爆破的小船魚貫而入，水雷被投進江中。伴隨著一聲接一聲劇烈的爆炸聲，清軍精心佈置的水下暗樁接連被炸成了一截截木頭，漂浮到江面上，被水流沖走，變成了對明軍大船無害的水上垃圾。
後面的明軍大船跟了上來，衝入小船炸開的航道，向清軍水師的大小船隻碾壓過去。
大船上火炮轟鳴，把試圖接近的清軍火攻船一艘接一艘擊沉到江底。有些漏網的清軍火攻船，則被明軍小船攔住。
清軍火攻船被消滅，剩下的清軍水師戰船在明軍戰船面前只不過是一群待宰的豬羊罷了。明軍戰船衝入，憑藉著自己船大的優勢直接碾壓，把清軍小船一艘接一艘撞沉，或者是乾脆直接碾壓到江底去。
馬江口的海戰一直激戰到天亮，等到第一縷陽光照射到江面上的時候，江面上已經看不到一艘清軍的船隻，沒跑掉的清軍船隻都被擊沉或者被俘，倖存下來的清軍船隻早就跑了，狼狽逃回福州城下。
逃回去的清軍戰船不多，一百多艘福州清軍水師戰船，只有二十多艘逃了回去，其餘的不是被擊沉就是被俘。
馬江口的炮臺上，綠色的綠營清軍旗被降了下來，換上了紅色的明軍戰旗。
明軍佔領了馬江口，因為在馬江口的清軍不多，清軍6師主力都在福州城內，所以登6的明軍幾乎不費吹灰之力就攻克了馬尾鎮，佔領了馬尾港。
王新宇的旗艦靠上了江中間的馬礁，停靠在岸邊，王新宇和王餘佑等人從大船上下來。