本來西班牙人和葡萄牙人對這樣的戰利品分成還頗有些不滿意，但張玉坤答應讓西班牙和葡萄牙在巴達維亞投資建設港口，並根據王新宇事先給他的提議，對西班牙和葡萄牙等國開放開放巴達維亞和新加坡等港口，以優惠價格給他們提供貨物。
從長遠角度來看，西班牙和葡萄牙獲得了明國給予的“貿易最惠國”待遇，有了這個待遇之後，他們能夠賺到更多錢。
另外，西班牙和葡萄牙無論是出兵人數還是出動的艦船都不多，能夠分到價值六百萬兩白銀的戰利品，他們其實也很滿意了。這次出來收拾荷蘭人，這兩個國家基本上沒有受到什麼損失，還獲得了巴達維亞港口的停靠權。
李定國拿到了一千五百萬兩銀子，也很滿足了，那麼多銀子，遠過他之前的想象。儘管他知道張玉坤還偷偷收了一批銀子，但他也當成不知道一樣沒有吱聲，拿到戰利品之後，李定國就帶上三千人馬撤回緬甸，留下兩千人協助南洋海軍駐守巴達維亞。
“晉王離開這裡了，接下來我們要做的事情就是加固炮臺，增加新的火炮。”張玉坤開始安排加固巴達維亞炮臺的工程。
巴達維亞被明軍攻佔了之後，按照中國人的習慣改名成椰城。至此，南洋海軍在東南亞有了三座港口延平港、獅城港和椰城港。
延平港和獅城港的建設比較早，防禦堅固。延平港是以河港出海的港口，在入海口布置水雷，叢林裡面佈置隱蔽的炮臺，荷蘭人就無法攻下這座港口，更何況延平港位置隱蔽，荷蘭人還不知道這裡。至於獅城港，位置十分重要，扼守住馬六甲海峽要衝，南洋海軍在這裡建造了最堅固的炮臺，佈置了最新銳的重炮。所以說，不管是延平港還是獅城港，荷蘭人都不可能拿得下來。
至於明廷所在的興都港，荷蘭人也沒那麼容易進去。先那是大金沙江入海的港口，下游三角洲河道複雜，荷蘭人無法探明航道水深情況，大型戰船不敢貿然進入江口內。而小船進來，興都的炮臺可不是吃素的。
張玉坤比較不放心的就是椰城炮臺，原來荷蘭人修建的四座炮臺，上面雖然設有六十四磅重加農炮和三十二磅重加農炮等重炮，可是這些重炮的數量不多，遠距離射擊，這些重炮的精度也不高。若是荷蘭艦隊要強行突破進入港內，僅僅依靠這四座炮臺，根本無法擋住擁有大量戰列艦的荷蘭艦隊。
要堵住荷蘭人進入椰城港區內，就要對炮臺和港灣口重新進行佈置。
椰城港灣的入口處比較開闊，並不是很有利於防守，四座炮臺難以完全封死港口。因此張玉坤先要做的是，對港區的航道進行佈置。
一些本來就比較淺，但是大船可以進出的航道，派人打下水下暗樁。主航道上，佈置了大量水雷。
最早的時候，萬曆年間使用的水雷是木殼雷，鄭成功後來又造出了陶瓷雷。現在王新宇使用的是經過改進的陶瓷水雷。
陶瓷外殼水雷也是一種使用鋼輪燧引信的水雷，這種水雷使用石蠟密封防水，水雷外殼上面開了五個孔，銅管插入孔內。在銅管裡面安裝有鐵製的觸角，伸出水雷外面。這種觸角其實就是一種用來撞擊的引信。當敵艦撞上觸角，觸角就會被壓縮，引水雷裡面的鋼輪轉動，燧石點火，點燃引藥，導致火藥爆炸。
這種專門用來對付大型艦船的水雷每一枚都有兩百多斤重，看起來就好像小口的大水缸一樣，內部裝填了一百多斤黑[火]藥，只要一枚水雷爆炸，就能在船底炸開一個直徑五米的大洞，這樣的爆炸威力，足以炸沉七省級戰列艦。
水雷底部有鐵環，上面掛上鐵鏈，固定在海底，可以避免水雷被海水沖走。
飛剪快帆船從東番槍炮廠運來了一百多枚新式水雷，水雷運到之後，明軍水手們就駕駛著佈雷的小船，在椰城港灣外圍佈置水雷。
椰城港口主航道水深比較深，漲潮時可以達到十五米深。如果只是簡單的把水雷丟下去，放下錨鏈，那麼錨鏈可能在水底扎得不穩，而導致水雷被水流帶走。為了保證佈雷的可靠性，明軍在退潮的時候佈雷。佈雷的水兵都是水性最好的水兵，他們身上捆著繩索，從小船上滑下來，沿著一根粗木潛入水底。
小船上的人把水雷推入水中，因為水雷底部的錨鏈重量大，原本可以漂浮在海面的水缸被錨鏈帶入水中。
潛入水底的明軍水兵嘴裡含著一根用來通氣的竹管，潛入水底打下木樁。然後把水雷錨鏈固定在海底的同時，又拉出一條鐵鏈，把錨鏈拴在木樁上。
佈置水雷的同時，在一些水比較淺的次要航道上，明軍水手潛入水底，打下水底暗樁。
儘管水雷和水底暗樁無法完全阻攔荷蘭艦隊進入椰城港內，但是在航道上佈置了水雷和水下暗樁之後，再加上岸上炮臺的封鎖，就能完全阻攔住荷蘭人的艦隊。因為荷蘭人若是要排除水雷，或者是派人去摧毀水下暗樁，他們的艦隊就不得不停在雷區前面，那樣就落入了炮臺火力覆蓋範圍內。
如果荷蘭人大艦不進來，而是用小船來排除水雷的話，那麼剛剛佈置在炮臺上的新式小炮就能精確的擊毀小船。
新式小炮，是在王新宇的要求下生產的四門三磅前裝六角線膛炮，這四門炮不久前剛剛才完工，從東番槍炮廠生產出來。它們原本是配備給6軍的，打算用來攻打廣州之類的堅城的時候，專門用來壓制清軍炮臺所用。但張玉坤卻把這四門炮暫時借了過來，安置在炮臺上面，專門用來對付荷蘭人的小船。
三磅線膛炮射的實心炮彈威力比三磅滑膛炮要大了很多，而且射程遠，精度非常高，打荷蘭人用來排除障礙的小船，完全可以一炮擊沉一艘船。
小型三磅前裝六角線膛炮只不過是臨時安放在炮臺上的，不需要另外固定。這些小炮運到椰城炮臺之後，在碼頭上卸下，直接就拉到炮臺上，沒有拆掉炮輪子就架起來，和6軍炮一樣只要把後面的炮鋤固定好，以兩輪來支撐，只要瞄準了就能打。用完之後，再裝船送去福建給王新宇的6軍使用。
當然這種小炮無法擊沉荷蘭人的大型戰艦，像新加坡炮臺的那種大型六角炮或者是明軍快戰艦上的那種大型六角炮，價格又過於昂貴，不可能多造。為了加強炮臺火力，張玉坤向葡萄牙人和西班牙人購買了十八門六十四磅炮臺炮。
葡萄牙人和西班牙人把一萬兩千多磅重的巨炮裝上船，送往椰城。這些炮本來就是馬尼拉炮臺的炮和澳門炮臺的炮，葡萄牙人和西班牙人不需要另外造炮，他們把現成的炮上報，宣佈報廢，然後賣給王新宇。
有了這十八門六十四磅加農炮，加上炮臺上面本來的十六門六十四磅加農炮，再加上三十二磅炮和不計其數的小炮，荷蘭艦隊若是進入椰城港灣，必然會被威力強大的炮臺炮打得焦頭爛額。
荷蘭人所有的戰列艦加起來火力肯定要過炮臺，但是炮臺炮射程遠，而且炮臺不會被打沉，戰列艦隻要捱上多六十四磅加農炮的炮彈，就會被擊沉。
為了防止荷蘭人從炮臺背後登6，使用6軍來攻擊炮臺，張玉坤把大批明軍原來淘汰下來的虎蹲炮和佛郎機炮安放在炮臺後面，並在炮臺後面修築了不少鐵芯水泥的碉堡，這些舊式的火炮就放在城堡裡面，專門用來對付荷蘭的步兵。