甄別工作比較繁瑣而困難，甄別工作進行的同時，明軍修復新會城牆，準備以新會當成一個阻敵點，用來阻攔孔四貞同尚可喜之間的聯絡。
若是要打一場大規模的阻擊戰，新會是一個很不錯的地方。這裡一面靠著銀洲湖，也就是珠江水系三角洲諸河潭江的下游河段。從新會縣溟祖咀至崖山門口稱銀洲湖，又稱潭江溺谷灣，這裡江面寬闊，五千噸級海輪可以直接進入新會城下。
這個年代當然不可能有五千噸級海輪，不過對於擁有水師優勢的瓊州軍來講，這一條深水河道卻是對明軍是如虎添翼，明軍的西式巡航艦和中式福船型炮艦，都能抵達新會，協助新會明軍守城，而且控制了河道的明軍擁有水運便利，清軍也無法圍困。而明軍卻是想打就打，想走隨時可以走。
明軍對新會城牆進行修復，同時還在城牆上面修建稜堡。
水泥這種東西，讓新會人可以說是大開眼界，只見工匠們在城牆外面挖出地基，用船運來的石頭被填入地基中。之後工匠們就在石頭上面鋪設上木板，裡面放入鐵芯，再把一種溼潤的泥土灌進去。
等到那些“溼土”乾燥了之後，就變成得和石頭一樣堅固，一座稜堡就這樣完工了。
城牆上，每隔百步一座稜堡。稜堡的高度三丈二尺，比城牆高度高了一丈多高，稜堡底部是實心的，高過城牆的部分是空心了，裡面是碉堡，牆壁上開出射擊孔，裡面可以駐紮火槍手；稜堡頂部，有女牆垛口，上面的平臺能佈置弓箭手。
損壞的城牆都得到了修復，城上佈置了炮臺，在上面架起十二磅和六磅的大炮，另外有兩門剛剛造出來的前裝六角線膛三磅炮也被運了過來，被當成機動火炮使用，專門用來對付清軍的炮兵。
看到明軍在新會緊張的施工，新會人只覺得心中害怕，他們擔心明軍守不住新會，倘若被清軍再奪回新會，必然要大規模屠城。
江邊，一艘艘大船停靠在岸邊碼頭上，船上卸下的物資堆積如山。大批的糧食，火藥等軍用物資送來，空的船停泊在岸邊，似乎要等著把什麼東西運走。
新會的老百姓們站在岸邊，指著那些空船議論紛紛。
“這次船丟卸掉貨物了，怎麼還不走？”
“還沒裝上東西呢，怎麼能走？”
“他們要裝什麼東西？我們新會又有什麼東西值得他們裝走的？要糧食沒糧食，要銀子沒銀子。”
“是海寇，他們來就是搶東西的。沒看到還很多人被他們抓走了嗎？估計在嚴刑拷打，要逼問出埋起來的銀子吧！”
“哎！海寇真不是好東西！和韃子差不多！還不如當年放老本賊進來了。”一名頭鬍子全部白了，牙齒都掉光的老頭子嘆了一口氣道。
明軍這些船停著沒走，確實是要準備裝東西走的，不過要裝走的卻不是貨物，而是人。那些參加過抗拒明軍的新會民壯，即將被甄別出來殺掉一批，再抽三殺一殺掉一批，剩下還有一半左右的人，都要裝上船送走，送去當苦力。
城內的甄別和稽核工作總算是完成，除了準備處死的綠營清兵之外，新會民壯練總、衙門的捕頭，捕快和衙役的班頭，還有一些強烈叫囂堅守新會計程車紳、吏員，全部都被甄別出來，同綠營清兵關押在一起。
而那些主動給清廷賣命，甚至不惜逼迫自己的妻兒去城外當肉盾的民壯，也被選了出來。明軍攻城的時候，有一批婦孺老弱，不顧明軍警告，也不顧明軍推進，螳臂當車，白白斷送了自己的生命，那些婦孺老弱並非是他們自己想死，都是被逼著離開城，去城下當肉盾的，而其中就有不少人是被自己的家人強迫去城外的。
經過分別審問，一批這樣的人都被揪了出來。
“你們自己要給韃子賣命也就算了！可是你們要賣命，卻讓你們的妻子兒女去送死！而且是強迫他們去送死！這樣的做法，你們還算是男人嗎？像你們這樣的人，就不配活在這個世上！你們必須對他們的死負責！”王新宇痛心疾的對這些民壯們說。
就算是其他“無辜”的民壯，也是抽三殺一！既然要死心塌地幫助韃子守城，那就必須為此付出代價！王新宇目前可沒有時間去耐心教導他們，現在的形勢不容樂觀，孔四貞的大軍馬上就要到了，他可不放心把那些不安定分子留下來。
這些人不僅毫無民族意識，而且他們堅信大明必敗，清廷必勝。若是留他們下來，一旦廣西清軍打過來，他們為了今後不遭到清軍的報復，肯定會在暗中動手腳，會開啟城門把清軍放進城內！
要解決隱患，時間又不夠，就只能用刀子說話了。
所有準備處死的名單列出來了，這一次是真正的大開殺戒，整個新會城內，一共有七千多人即將被處死。
“一次要砍那麼多人頭？”專程趕來，準備同新會當地人進行華夷之辨的顧炎武聽到這個數字，大吃了一驚，“這樣我們和韃子的屠城又有什麼區別？”
王新宇冷冷的回道“孔四貞馬上要打過來了！我不放心把這些不穩定因素留在城內！若是留住他們，孔四貞一來，開啟城門，本藩這裡只是一支偏師，能不能守住都難說！為了解決後患，只能快刀斬亂麻！若是平時，本藩還能花點時間，讓你們去開導教化這些愚昧無知的愚民！”
“那你也可以把他們都送走啊！”顧炎武道。
“一來沒那麼多船，二來，這裡的婦孺老弱死了那麼多，都是被這些人害死的，難道死去的那些人都白死了？必須有人為此付出代價！”王新宇斬釘截鐵的說道。
顧炎武道“大帥今日殺個人頭滾滾，不知來日史書會如何評價大帥啊！”
王新宇冷笑一聲“史書是勝利者譜寫的！韃子不是改了我們的明史？為了明史案，都殺了江南多少士子？待到本藩滅了韃子，史書就是我們寫！”