在檜皮鎮的東山上，有一片大森林。
這片森林長得十分茂盛，大樹之間縫隙密集，樹枝互相交錯。一般人是根本無法穿過這片森林的，甚至連進都進不去。
可就在這樣的森林的深處，有一個碩大的湖泊。
在這個湖泊的旁邊，有著一座碩大的研究所。
這個研究所十分碩大，但看起來卻十分樸實。
普普通通的外牆，用水泥製造的巨型房頂，還有那連石板都沒有的院……明著這個研究所的貧窮。
但就是一個這樣普普通通的研究所，佔地面積卻十分龐大。
其實，知道內情的人都知道，這座研究所雖然外表看起來十分樸實，但內部卻十分豪華。不僅如此，在這座研究所的內部，還有著許許多多的高科技機器……這一切，似乎在明這座研究所的科技十分達。
但是，就這樣一個碩大而又有著高科技的研究所，裡面卻只有一個人。
這個人身體型比較瘦，有著一頭青藍色的頭，穿著白色的研究服……這種人無論怎麼看，都不過是一個普普通通的研究員。
但又有誰知道，這個研究員其實是一名失落的學者。他曾經在學術界的地位十分高大，還表過許許多多精彩的論文。
可是，就這樣的一個學者，竟然被學術界的其他人所鄙視和排斥，不僅僅像大木博士這樣的學術界的高權重的博士反感這名學者，就連那些初入學術界的普通研究員也不給這名學者一個正眼。
“為什麼？我們都是神奇寶貝的學者，為什麼你們要排斥我？到底是為什麼？為什麼你們從來都否認我的觀點呢？我寫了那麼多精彩的論文，現了那麼多精彩的現象，可你們為什麼卻一直是排斥我呢？”
這名學者一開始曾經和那些鄙視和排斥他的人針鋒相對。後來，這名學者厭倦了，他不想再和其他人爭吵了。於是，這名學者開始隱忍了起來。別人指責他，他用笑臉來回應；別人鄙視他，他卻一笑而過；別人排斥他，他卻默默走到了角落裡……
但其實，無論再怎麼隱忍，人終歸是有底線的。當觸破磷線之後，人便會將自己的怨恨爆出來。
終於到了某一，這名學者再也無法隱忍下去了！
在一個話題上，這名學者和其他學者爆出了猛烈地爭吵。爭吵過後，其他的學者們聯手將這名學者轟出了學術界。而這名學者也針鋒相對，當著眾多學者的面，讓自己曾經的論文和記錄，全部撕毀，然後一把火自己曾經的研究所焚燒得乾乾淨淨。
“我一定會將幻影神奇寶貝系統製造出來的！我會證明我的結論是正確的！你們都等著瞧吧！笑到最後的才是英雄！遲早有一，我會復仇的！你們所有人復仇！”
在向著其他的學者們嘶吼過後，這名學者憤然地離開了學術界。
隨後，這名學者在城都（cd）地區一邊四處流浪，一邊著手進行自己的研究。
就這樣，這名學者一邊四處流浪，一邊著手進行自己的研究。
這名學者就這樣過了四年。
直到某一，這名學者來到了檜皮鎮……
在一個偶然的機會中，這名學者在檜皮鎮的東山上的森林旁邊，現了一條通往森林深處的隱蔽路。
在穿過這條隱蔽的路之後，這名學者來到了檜皮鎮中山上的森林的深處。
這名學者來到了森林的深處之後，他頓時被眼前的一幕給驚呆了！