喬飛拿起手機,直接撥梁曉慧的電話。
只響了一聲,對方就接通了。
“174大神!額,不對……喬飛,什麼事?”電話另一邊的聲音有些驚訝。
“有點事情請教你…”喬飛說道。
“什麼?有事情要請教我?你這麼快就在學習生物資訊學了?不錯耶!”聲音從驚訝轉為了興奮。
“我是正在研究。”喬飛不想讓她失望,先肯定的說道。
果然,電話那頭一陣歡呼…
“現有有點事情需要你幫個忙。”喬飛接著說道。
“沒問題。”梁曉慧斬釘截鐵的承諾“說吧!”
“對於我缺失的那段dna,2.7kb的,我想知道這一段dna序列上有多少個snp,或者sTR也行,我對ncBI這個庫不太熟悉,怕自己查的資訊不準。”
“好的,沒問題,sTR估計不會有的,因為這段dna是外顯子,一般不會有sTR,snp肯定會有的,我馬上去確認。話說ncBI你怎麼能不會用,這可是學生物資訊學的基礎,你要儘快掌握哈,過兩天不忙了我去教你,包教包會…”
電話那頭滔滔不絕的熱情,讓喬飛莞爾。
……
用那段dna確定是否和蔣慕軒有關,必須知道這段序列上,有多少snp位點或者sTR資訊。
因為人與人的dna序列,有99.9%都是相同的,必須測定那些人與人之間不同的核苷酸位點,才能說明問題,這也是親緣關係鑑定的技術原理。
喬飛問梁曉慧這段序列上的snp與sTR變異,就是為了找到這段序列上的不同,如果這些人與人之間不同的點,和蔣慕軒卻相同,就能夠證明了。
snp,單核苷酸多型性,簡單來說,指的是經常出現的單個dna位點的變異,這和單點基因突變只有不到1%人群機率不同,這種變異廣泛存在。
比如現某個基因位點,有7o%的人是TT型,有19%是cT型,有11%是cc型,這三種型別的人,出生的時候,沒有明顯的個體差異。
如果這個基因位點有99%以上的人都是同一型別,只有不到1%的人不一樣,這屬於基因突變而不是snp變異,基因突變一般情況下,是會引起嚴重的疾病的。
從喬飛出生的2oo2年左右開始,世界範圍內開始了針對snp變異的廣泛研究,現了這一類的變異,雖然不會直接導致個體的差異,卻會讓人產生一些不同——患上某種疾病機率的不同。
就像上面的基因型,大部分人是TT型的,結果經過統計現,cT型的人,比TT型的人,更容易患上糖尿病…
所以大概2oo8年左右,整個世界範圍內,出現了大量針對snp位點進行測序服務的公司,透過檢測snp變異,告訴受檢者容易患上哪種疾病,提前預防…市場火熱了十多年——京西商城上面的那些基因檢測產品,都是此類。
而sTR,是dna的短串重複序列,是指的dna序列上某些固定序列的重複,重複的數量,人與人之間也經常不同。
如5’—aTcggagagagagagacTagTa—3’這段序列,sTR指的就是其中的ga,重複了六次,而有些人是七次,有些人是五次,一般情況下,也不會引起個體太大的差異。
但是無論snp還是sTR,都可以作為喬飛鑑定的依據。
再次思考了一次自己的邏輯,喬飛覺得沒有任何問題,果斷的將自己具有2.7kb基因序列的全基因組資料,和蔣慕軒的基因資料,一起上傳到梁曉慧做的程式中。
如果系統能夠直接分析基因序列,就太好了,喬飛喃喃自語。
不過現在不用著急,系統以後會升級的,也許真的就會有這個功能也說不定,喬飛感覺對自己的系統,還是充滿希望的,即使到現在也沒搞清楚它升級的經驗,到底是什麼鬼。
喬飛直接從梁曉慧的程式裡面進行設定,只比對那2.7kb的dna序列——因為其他的dna片段根本沒有任何必要。
因為資料少,綠色的進度條几乎一秒鐘,就跑到了盡頭。
而顯示的結果,則是——完全相同!
自己那缺失的2.7kbdna片段,那段莫名其妙回到自己細胞中的dna片段,果然和蔣慕軒的——一模一樣!